呼吸道合胞病毒感染SPC-A1相关新基因zlg10con的电子克隆及分析和验证

呼吸道合胞病毒感染SPC-A1相关新基因zlg10con的电子克隆及分析和验证 In Silico Cloning and Verification of Novel zlg10con Gene Involved in Infection of RSV on Host SPC-A1 Cells 李蕾 LI Lei 1 1 2 3 4 first-author 赵东赤 ZHAO Dong-chi 1 1 2 3 4 张楚瑜 ZHANG Chu-yu 1 1 2 3 4 李乐 LI Le 2 1 2 3 4 游上游 YOU Shang-you 2 1 2 3 4 黄静宁 HUANG Jing-ning 2 1 2 3 4 武汉大学生命科学学院病毒研究所 武汉大学生命科学学院病毒研究所 Institute of Virology, College of Life Sciences,Wuhan University Institute of Virology, College of Life Sciences,Wuhan University 武汉市儿童医院 武汉市儿童医院 Children Hospital of Wuhan Children Hospital of Wuhan 武汉市儿童医院,湖北,武汉,430072 武汉市儿童医院,湖北,武汉,430072 ,湖北,武汉,430020 ,湖北,武汉,430020 通过mRNA差异显示法获得了与呼吸道合胞病毒感染SPC A1细胞相关的 5 2个表达序列标签（EST）片段 ,其中的一个EST片段 g10 1在RSV感染后的细胞中高表达 .采用生物信息学原理和方法对g10 1进行了鉴定后预测这是一个新基因片段 ,经电子克隆获得了 76 1bp的延伸产物 ,并且通过了实验验证 .该基因片段含有一个典型的 5 4个氨基酸的ORF ,命名为zlg10con ,并对该序列进行了蛋白结构和功能的分析 In order to study the key genes involved in infection of RSV on host SPC-A1 cells, 52 ESTs sequences have been derived through DDRT-PCR. Among all the ESTs, g10-1,upregulationed of its expression,is identified to be a novel gene fragment by bioinformatics methods.Finally,761 bp contig products were obtained by contig,named as zlg10con,the open reading frame of zlg10con gene encodes a putative protein containing 54 amino acid residues.The zlg10con full-length cDNA sequence bas been verified and followed analysis the structure and functions of the potential protein. 生物信息学 呼吸道合胞病毒 电子克隆 表达序列标签 bioinformatics respiratory syncytial virus（RSV） in silico cloning expressed sequence tags（EST） R346 2003-04-01 2021-04-01 4