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HMDA:基于HMAC的DNA组装算法
更新时间:2024-05-06
    • HMDA:基于HMAC的DNA组装算法

    • HMDA: HMAC Based DNA Assembly Algorithm

    • 针对基因组学研究中至关重要的DNA组装步骤,一项基于HMAC的DNA组装算法——HMDA的研究取得了重要进展。该算法旨在解决传统基因组组装算法存在的数据完整性、准确性、内存消耗和安全性等问题。HMDA算法运用HMAC技术对组装信息进行编码,利用密码子性质在基因组内嵌入加密信息。这些信息在组装过程中被提取,作为筛选正确序列的关键依据。此外,HMDA通过映射不同密钥与物种或用户,实现了特定物种或用户的身份验证。实验结果表明,HMDA算法具有显著优势。它能准确、完整地组装理论上能够恢复的基因组测序文库,同时从混合物种基因组数据中成功分离出不同物种。相较于其他算法,HMDA的空间消耗降低了66.6%,且安全性更强。授权用户和普通用户的组装结果不同,该算法还能检测数据篡改并返回错误状态码。这一研究成果为基因组学领域的数据组装提供了更安全、高效的方法,有望推动基因组学研究的进一步发展。
    • 武汉大学学报(理学版)   2024年 页码:1-10
    • DOI:10.14188/j.1671-8836.2023.0226    

      中图分类号: TP391
    • 网络出版日期:2024-05-06

      收稿日期:2023-11-12

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  • 崔竞松,王兰兰,郭迟.HMDA:基于HMAC的DNA组装算法[J].武汉大学学报(理学版),XXXX,XX(XX):1-10. DOI:10.14188/j.1671-8836.2023.0226. DOI:

    CUI Jingsong,WANG Lanlan,GUO Chi.HMDA: HMAC Based DNA Assembly Algorithm [J].J Wuhan Univ (Nat Sci Ed),XXXX,XX(XX):1-10. DOI:10.14188/j.1671-8836.2023.0226(Ch). DOI:

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